Szanowni Państwo,

Medycyna Praktyczna wykorzystuje w swoich serwisach pliki cookies i inne pokrewne technologie. Używamy cookies w celu dostosowania naszych serwisów do Państwa potrzeb oraz do celów analitycznych i marketingowych. Korzystamy z cookies własnych oraz innych podmiotów – naszych partnerów biznesowych.

Ustawienia dotyczące cookies mogą Państwo zmienić samodzielnie, modyfikując ustawienia przeglądarki internetowej. Informacje dotyczące zmiany ustawień oraz szczegóły dotyczące wykorzystania wspomnianych technologii zawarte są w naszej Polityce Prywatności.

Korzystając z naszych serwisów bez zmiany ustawień przeglądarki internetowej wyrażacie Państwo zgodę na stosowanie plików cookies i podobnych technologii, opisanych w Polityce Prywatności.

Państwa zgoda jest dobrowolna, jednak jej brak może wpłynąć na komfort korzystania z naszych serwisów. Udzieloną zgodę mogą Państwo wycofać w każdej chwili, co jednak pozostanie bez wpływu na zgodność z prawem przetwarzania dokonanego wcześniej na podstawie tej zgody.

Klikając przycisk Potwierdzam, wyrażacie Państwo zgodę na stosowanie wyżej wymienionych technologii oraz potwierdzacie, że ustawienia przeglądarki są zgodne z Państwa preferencjami.

Potężna symulacja zachowania HIV w komórce

Potężna symulacja zachowania HIV w komórce
Fot. Pixabay.com

Na łamach „Nature Communications” zespół z University of Illinois w Urbana-Champaign (USA) opisał wyniki symulacji, obejmującej 64 miliony atomów, która pokazała, jak kapsyd HIV, czyli białkowy płaszcz wirusa, zachowuje się w komórce i umożliwia dokończenie infekcji. Bezcenne informacje ujawniają słabości wirusa.

"Poznajemy szczegóły na temat kapsydu HIV, nie tylko jego struktury, ale także tego, jak zmienia swoje środowisko i na nie reaguje” - opowiada główny autor badania prof. Juan R. Perilla.

Jednym za autorów symulacji jest prof. Klaus Schulten, pionier zastosowania komputerów do symulowania złożonych systemów biologicznych. Opracowaną przez siebie technikę nazwał on komputerową mikroskopią.

Jej wymagania są potężne. Superkomputer Tytan w Departamencie Energii potrzebował 2 lat, aby opracować dane do symulacji 1,2 mikrosekundy zachowania kapsydu HIV. Do analizy tych danych potrzebny był drugi superkomputer w National Center for Supercomputing Applications przy University of Illionis Urbana-Champaign.

Kapsyd ma skomplikowaną budowę - składa się z setek identycznych białek ułożonych w sieć sześcio- i pięciobocznych struktur, a każda z nich ma w środku mały otwór. Oprócz tego, że płaszcz ten osłania materiał genetyczny wirusa przed układem odpornościowym, pozwala mu także na przeniknięcie do jądra komórkowego, co jest niezbędne dla dokończenia zakażenia.

Symulacja ukazała kilka ważnych właściwości kapsydu HIV, które prawdopodobnie pomagają mu właśnie przedostać się do jądra komórki. Okazuje się na przykład, że jego różne części oscylują z różnymi częstotliwościami, które prawdopodobnie przekazują informację z jednej części do drugiej.

Projekt pokazał też, że w dodatnio naładowanym wnętrzu kapsydu gromadzą się ujemne jony, a na zewnątrz zbierają się jony dodatnie. Dodatnio naładowane wnętrze kapsydu może wspomagać napływ do niego negatywnie naładowanych składników DNA, których wirus potrzebuje, aby się rozmnożyć.

Naukowcy odkryli też m.in., że powstające na kapsydzie napięcia układają się we wzory obejmujące rejony, które według eksperymentów są najbardziej podatne na zniszczenie.

Takie informacje są bezcenne dla naukowców, którzy szukają nowych sposobów na walkę z wirusem. „Jeśli udałoby się zakłócić tę elektromagnetyczną równowagę, którą kapsyd stara się utrzymać, być może udałoby się permanentnie go zniszczyć” - mówi prof. Perilla.

Data utworzenia: 21.07.2017
Potężna symulacja zachowania HIV w komórceOceń:
Zobacz także

Zaprenumeruj newsletter

Na podany adres wysłaliśmy wiadomość z linkiem aktywacyjnym.

Dziękujemy.

Ten adres email jest juz zapisany w naszej bazie, prosimy podać inny adres email.

Na ten adres email wysłaliśmy już wiadomość z linkiem aktywacyjnym, dziękujemy.

Wystąpił błąd, przepraszamy. Prosimy wypełnić formularz ponownie. W razie problemów prosimy o kontakt.

Jeżeli chcesz otrzymywać lokalne informacje zdrowotne podaj kod pocztowy

Nie, dziękuję.